Komplexets rika arkitektoniska historia började med slutförandet av den första museibyggnaden, byggd 1939 av Philip L. Goodwin och Edward Durell Stone, och det blev omedelbart klart att det inte fanns tillräckligt med utrymme. Philip Johnson byggde ytterligare två byggnader för MOMA - 1951 (rivs nu) och 1964. Cesar Pelli lade till utställningsutrymmen till komplexet, liksom ett 52-våningshus "Museum Tower".
Taniguchi, som arbetade med återuppbyggnadsprojektet tillsammans med Kon Pedersen Fox-byrån, försökte bevara alla spår av den tidigare omstruktureringen och lyfta fram oväntade vinklar i dem.
Trots att 1900-talet är över och länge har den mest moderna konsten ställts ut på Guggenheim-museet, gav arkitekten inte byggnaden ett intensivt fokus på framtiden. Tvärtom överför den betonade linjäriteten och de släta ytorna på väggarna fullständigheten av denna historiska upplevelse.
Den nya lobbyn med en fasad av grått glas och svart granit föregås av en ensemble av byggnader från olika tider. Inuti, som passerar längs en rad vita kolonner, kommer besökaren in i ett stort atrium, runt vilket utställningsgallerierna på alla sex våningarna är koncentrerade. Ljusbroar längst ner i lobbyn förbinder hallarna på olika nivåer.
Senare verk finns på de nedre nivåerna, tidiga, ovillkorliga klassiker från 1900-talets konst - högst upp.
När besökaren tittar ner från hallarnas övre nivå ser han bland ljuset och så att säga lösa upp i luftarkitekturen de viktigaste verken under en viss period. Tittar genom glasväggen på en av fasaderna i Taniguchi-annexet, Rodins Balzac och italienska sportbilar är samtidigt synliga i gallerier på olika nivåer.
En speciell plats i museets ensemble är upptagen av en trädgård med gråtande björkar och marmorbroar, som ligger bakom glasväggen i lobbyn. Den ligger på låga terrasser som ger den en rymlig känsla. Tillsammans med den nya byggnaden med sex våningar öppnar gamla byggnader, som nu rymmer ett utbildningscenter, ett filmbibliotek och ett fotoarkiv, ut i trädgården.
